Prezidenta NKÚ obžalovala obvodní státní zástupkyně pro Prahu 7, případ bude projednávat Obvodní soud pro Prahu 7. Při prokázání viny by mu za zneužití pravomoci úřední osoby hrozilo vězení od dvou do deseti let.
Dokumenty, které Dohnal odmítl kontrolorům vydat, měly sloužit k provedení auditu hospodaření Nejvyššího kontrolního úřadu. Šéf NKÚ je dlouhodobě kritizován za to, že plýtval státními penězi.
Po obstrukcích při kontrole účetnictví obvinila šéfa NKÚ protikorupční policie. Dohnal odmítl vydat dokumenty pro audit hned několikrát po sobě. Za to, že bránil kontrole, Dohnal zpočátku zaplatil pokutu 50 tisíc korun. Když šéf kontrolního úřadu ani později nechtěl dokumenty vydat, podal na něj člen sněmovního kontrolního výboru další trestní oznámení, které nakonec skončí soudem.
Poprvé odmítl Dohnal s auditory firmy KPMG spolupracovat v prosinci roku 2009.
