Přejmenování i vznik nových zastávek schvaluje Drážní úřad. Přejmenování obvykle iniciují obce, kterým se název nelíbí. Jedním z takových příkladů je zastávka Srbská na trati z Liberce do Jindřichovic pod Smrkem. Ta leží sice na katastru Jindřichovic, přesto nese název podle části sousední obce Horní Řasnice vzdálené čtyři kilometry. Od nového jízdního řádu se proto zastávka jmenuje Jindřichovice pod Smrkem - skanzen. Zastávka je totiž v blízkosti Živého skanzenu provozovaného občanským sdružením Lunaria.
Podobné je to se zastávkou Račiněves, dosud konečné stanici trati Roudnice nad Labem - Račiněves. Ta leží přímo na kraji obce Bříza, přesto se jmenuje Račiněves. Od nového jízdního řádu se jmenuje Bříza obec, přejmenuje se i trať číslo 096.
| trať | původní název | nový název |
|---|---|---|
| 037 Liberec - Jindřichovice pod Smrkem | Srbská | Jindřichovice pod Smrkem - skanzen |
| 096 Roudnice nad Labem - Břiza | Račiněves | Břiza obec |
| 086 Liberec - Benešov nad Ploučnici | Božíkov | Zákupy - Božíkov |
| 198 Strakonice - Volary | Zátoň | Zátoň - Boubín |
| 198 Strakonice - Volary | Zátoň zastávka | Zátoň |
| 212 Čerčany - Světlá nad Sázavou | Sázava - Černé Budy | Sázava |
Kromě přejmenovaných zastávek se objeví v jízdním řádu i nové železniční zastávky. Některé jsou již připravené na provoz: už na konci listopadu otevřeli zástupci železnice a politici zastávku u Amazonu v Dobrovízi, připravená je i nová zastávka v Července.
| trať | nová zastávka | umístění |
|---|---|---|
| 120 Praha - Rakovník | Praha - Bubny Vltavská | km 0,251 - 0,371 |
| 121 Hostivice - Podlešín | Dobrovíz - Amazon | v km 27,1 - 27,3; otevřena 29. 11. 2016 |
| 224 Tábor - Horní Cerekev | Tábor - Měšice | v km 66,960 - 67,020 |
| 241 Znojmo - Okříšky | Lesůňky | v km 148,657 - 148,717 |
| 273 Prostějov - Červenka | Červenka zastávka | v km 1,566 -1,626; se zahájením nového JŘ |
| 321 Opava - Český Těšín | Havířov střed | v km 16,935 – 17,105 |
| 340 Brno - Uherské Hradiště | Veselí nad Moravou -Milokošť | v km 89,962 - 90,062 |
| zdroj: Drážní úřad |
Další zastávky teprve stavba čeká. Zřejmě nejpozoruhodnější na celém seznamu jsou Lesůňky, kde žije necelá stovka obyvatel. Na Třebíčsku přitom o zastávku marně roky bojuje na jiné trati obec Stařeč, která chce zastávku na trati Jihlava - Brno.
„Posílají nás od čerta k ďáblu. Však to znáte, státní železnice v Česku, to je moloch různě propojených organizací a pracovišť, ve kterém není snadné se vyznat. Navíc jejich lhůty jsou nekonečné. Někdy mám pocit, že mě pošlou i pro razítko c. k. monarchie,“ posteskl si v únoru letošního roku v MF DNES starosta obce Čestmír Linhart.
Jedna zastávka naopak zcela končí. Zastávka Praha Na Knížecí na pražském Smíchově kvůli developerským plánům. Motorové vlaky linky S65 proto budou nově začínat na hlavním nádraží a zastaví na zastávce Praha-Smíchov severní nástupiště.
