Dráha se uzavírá pravidelně dvakrát do roka, na jaře a na podzim. Podzimní údržba se provádí vždy před začátkem zimního letového řádu, kdy je nutné zajistit mimo jiné potřebné brzdné účinky.
Na změny směru letů letadel nejvíce doplácejí obyvatelé okolních obcí a některých pražských čtvrtí. Vedlejší dráha vede směrem k hlavnímu městu a je téměř kolmá k hlavní. V době uzavírek tak letadla létají přes Řepy a obce v okolí. Samosprávy okolních obcí se proto dohodly s letištěm na omezení nočního provozu.
V první fázi opravy bude noční provoz v době od jedné do pěti ráno zastaven. Plánované noční lety byly po dohodě s leteckými společnostmi přesměrovány do hodin před a po termínu přerušení nočního provozu. Ve druhé fázi opravy hlavní dráhy budou letadla v noci využívat hlavní dráhu, uvedla mluvčí letiště Michaela Lagronová.
Přesuny provozu během údržby by měly skončit po dokončení nové ranveje, která má vést ve stejném směru jako nynější hlavní dráha. Termín jejího zprovoznění se odhaduje na léta 2013 až 2014.